Aydoğan Aydın, 5.6.1966'da Başçiftlik'te (Tokat) dünyaya geldi. 1977'de Şeker İlkokulundan mezun oldu. Daha sonra altı yıl boyunca öğretmen okulunda yatılı okudu. 1983'te girdiği Kara Harp Okulundan 1987'de teğmen rütbesiyle mezun oldu. 1988'de Topçu ve Füze Okulundan mezun oldu. 1988-1992 yılları arasında İstanbul 6. Piyade Tugay Komutanlığında takım komutanlığı yaptı. 1992-1998 yılları arasında Özel Kuvvetler Komutanlığında altı yıl boyunca tim komutanı olarak çeşitli operasyonlarda görev aldı. 1998'de kazandığı Kara Harp Akademisinden 2000'de mezun oldu. 2000-2002 yılları arasında Hakkâri Dağ Komando Tugay Komutanlığında Lojistik Şube Müdürlüğü ve Harekât Şube Müdürlüğü görevlerinde bulundu. 2002'de Özel Kuvvetler Tugay Komutanlığına Harekât Şube Müdürü olarak atandı. 2003-2005 yılları arasında tabur komutanlığı, 2005-2006 yılları arasında lojistik şube müdürlüğü, 2006-2008 yılları arasında yine Özel Kuvvetler 1. Tugay Kurmay Başkanlığı görevlerinde bulundu. 2008'de altı ay süreyle İtalya NATO Savunma Kolejinde öğrenim gördü. 2008-2010 yılları arasında Heidelberg'de (Almanya) bulunan NATO Karargâhında Tatbikat Daire Başkanlığı yaptı. 2010-2012 yılları arasında Gökçeada 5. Komando Alay Komutanı, 2012-2016 yılları arasında Kayseri 1. Komando Tugay Komutanı olarak görev yaptı. Tugay komutanlığı yaptığı dönemde Güneydoğu'da birçok operasyona katıldı. 2016'daki Yüksek Askerî Şura Kararları ile tümgeneralliğe terfi ettirilerek Şırnak 23. Jandarma Sınır Tümen Komutanlığına atandı. Bu görev sırasında, 31.05.2017'de yanındaki on iki askerî personelle birlikte elim bir kaza sonucu şehit olmuştur.